Calculateur de Peptides Calculateur
Calculez les propriétés des peptides telles que le poids moléculaire, la charge nette à un pH donné et le coefficient d'extinction à partir de la séquence d'acides aminés.
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Comment utiliser cet outil ?
Comment utiliser le calculateur de peptides
Cet outil calcule les propriétés clés d'un peptide à partir de sa séquence d'acides aminés. Suivez ces étapes :
- Saisissez la séquence – Tapez les codes d'acides aminés en une lettre (par exemple,
ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY) dans la zone de texte. Seules les lettres majuscules A–Z sont autorisées ; pas d'espaces ni de chiffres. - Définissez le pH – Entrez une valeur de pH entre 0 et 14 (la valeur par défaut est 7,0). Cela affecte le calcul de la charge nette.
- Spécifiez les ponts cystéine – Si votre peptide possède des liaisons disulfure, entrez le nombre de ponts (par exemple, 1 pour une liaison S–S). Cela ajuste le poids moléculaire et le coefficient d'extinction.
- Cliquez sur "Calculer" – L'outil validera les entrées et affichera trois résultats :
- Poids moléculaire (Da) – Somme des poids des résidus plus l'eau, moins 2,02 Da par pont.
- Charge nette au pH – Calculée à l'aide de l'équation de Henderson-Hasselbalch pour les extrémités N/C et les chaînes latérales (R, K, H, D, E, C, Y).
- Coefficient d'extinction (M⁻¹cm⁻¹) – Basé sur le Trp (5500), la Tyr (1490) et les ponts cystine (125 chacun).
Remarque : Toutes les entrées sont obligatoires. Les séquences ou valeurs de pH invalides afficheront une erreur. L'explication de la formule est affichée sous les résultats pour référence.
Résultats précédents
| Résultat | Entrées | Date |
|---|
Questions Fréquemment Posées
A peptide calculator computes properties like molecular weight, net charge, and extinction coefficient from an amino acid sequence.
Molecular weight is the sum of the residue weights of each amino acid plus the weight of a water molecule (18.02 Da), adjusted for cysteine bridges.
Net charge is calculated using the Henderson-Hasselbalch equation for ionizable groups (N-terminus, C-terminus, and side chains) at the specified pH.